已有的研究工作推测,许多复杂的进化变异,包含营养不良,都表现出异普遍性恋相异的构造。这些异普遍性恋相异被不同程度地归因于皮质醇、普遍性生殖细胞、子代×异普遍性恋效应、举动相异和环境暴露的相异。然而,至今为止,它们的机制和基本生命体学物理现象在很大程度上仍然是未知的。
子代-秘密组织表达(GTEx)项目提供了一个但他却,让我们可以通过研究工作许多以前未曾以这种方法连续普遍性的秘密组织,来聚焦进化mRNA组中异普遍性恋相异的普遍普遍性和普遍子代机制。
最近,研究工作其他部门在Science杂志转发。为了连续普遍性进化mRNA组及其调节的异普遍性恋相异,并断定异普遍性恋和普遍子代学如何相互直接影响复杂的普遍子代和营养不良,研究工作其他部门在GTEx项目(v8数据披露)事件调查的44个进化秘密组织是从中生成了调节及其普遍子代调节的异普遍性恋相异目录,并分析了16245个RNA测序样本和838个成年有机体的子代。
在此基础上,研究工作其他部门报告了调节低水平、秘密组织细胞类型组成和顺式表达定量普遍子代启动子(cis-eQTLs)的异普遍性恋相异。为了评估它们的直接影响,研究工作其他部门将这些结果与87个GWAS的DNA功能、mRNA连续普遍性结合释义和仅有DNA组相似之处研究工作(GWAS)汇总统计相结合。
结果推测,异普遍性恋对调节的直接影响是无处不在的 (在所有秘密组织中,研究工作其他部门核对了13 294个有异普遍性恋相异的DNA)。然而,这些直接影响很小,而且主要是秘密组织特异普遍性的。
具有异普遍性恋相异表达的DNA主要不是由秘密组织特异普遍性调节动力的,而是参与了一系列独特的生命体功能,如药物和激素中间体、胚胎发育和秘密组织型态发生、排卵、普遍性生殖和精子发生、脂肪代谢物、癌症和免疫中间体等。
而X连接DNA在男普遍性中表达很低,提示了逃避X生殖细胞失活的候选DNA,常生殖细胞DNA的异普遍性恋取向普遍性表达提示了与激素关的的mRNA连续普遍性调节和额外mRNA连续普遍性的作用,以及表征普遍子代学记号的异普遍性恋相异普遍性分布区,特别是组蛋白H3 Lys27三甲基化(H3K27me3)。
调节的普遍子代调节的异普遍性恋相异要少得多(在所有秘密组织中核对出了369个异普遍性恋取向的eQTL),并且具有离地的秘密组织特异普遍性。研究工作其他部门断定了58个由单一异普遍性恋的调节普遍子代调节动力的DNA-普遍子代相似之处。这些包含异普遍性恋相异的细胞类型丰度介导子代-变异相似之处的启动子,以及异普遍性恋可能在相似之处的潜在分子机制中发挥更直接作用的启动子。例如,研究工作其他部门在胰脏中断定了一个男普遍性特异普遍性的六激酶HKDC1的eQTL,它直接影响怀孕男普遍性的代谢物,随后凸显在后代的出生体形上。
因此,通过将GTEx数据的异普遍性恋意识分析与DNA功能和mRNA连续普遍性结合释义相倡议,研究工作其他部门描述了导致进化mRNA组和eQTLs异普遍性恋相异的秘密组织特异普遍性和秘密组织共享的动力因素和机制。
研究工作其他部门断定了多个异普遍性恋相异的调节效应,这些效应与复杂的普遍子代普遍子代相似之处共轭,从而促进了GWAS信号的机理断言。
由于许多变异的致病秘密组织是未知的,因此对独特的GTEx秘密组织利用的分析可以作为事件调查异普遍性恋偏倚普遍子代基础的稳固资源。这项工作对进化mRNA组的异普遍性恋相异及其普遍子代调节展开了广泛的连续普遍性。
独有说是:
Meritxell Oliva et al. The impact of sex on gene expression across human tissues. Science (2020). DOI: 10.1126/science.aba3066
相关新闻
相关问答